Sistemi software autoorganizzanti, e sistemi cellulari biologici hanno notevoli affinità, tanto che in alcuni casi di interesse possono essere analizzati/simulati mediante uno strumento comune da cui il termine generale di simulazione biochimica. Partendo da algoritmi noti per la simulazione di sistemi chimici (e più in generale sistemi stocastici tempo-continui), in questa tesi si dovrà implementare un prototipo di simulatore ad alte prestazioni per reti a larga scala, e collegarlo a strumenti standard per il recupero degli input e per la graficazione di risultati.
