L'obiettivo di questa tesi è quello studiare le prestazioni di diversi approcci di ottimizzazione per i parametri di un modello computazionale che descrive uno specifico sistema biologico. Come caso di studio è stato utilizzato un modello che riproduce i primi stadi di sviluppo della Drosophila Melanogaster, che generano l'iniziale
schema spaziale dell'espressione di alcuni particolari geni. Per raggiungere questo obiettivo, è stato utilizzato un framework composto
da un modello del sistema, un simulatore del modello e un valutatore che confronta i risultati delle simulazioni con i dati reali.