NETSCALE — Ricostruzione e modellazione delle dinamiche molecolari e genetiche alla base della precoce regionalizzazione degli embrioni di zebrafish e di seaurchin

• Funding Body: Università Italo-Francese — Project Galileo 2008/2009
• Project Acronym: NETSCALE :
• Project Full Title: "NETSCALE — Ricostruzione e modellazione delle dinamiche molecolari e genetiche alla base della precoce regionalizzazione degli embrioni di zebrafish e di seaurchin"
• Years: 2009-2010

Partners

• Alma Mater Studiorum—Università di Bologna, Cesena, Italy
  • Andrea Omicini (Coordinator)
  • Sara Montagna
  • Mirko Viroli
  • Matteo Campana
  • Alessandro Sarti
• DEPNS (CNRS), Gif-sur-Yvette, France
  • Nadine Peyriéras (Coordinator)
  • Sophie Desnoulez
  • Louise Duloquin

Publications

• An Agent-based Model for the Pattern Formation in Drosophila Melanogaster
  
• An Automatic Quantification and Registration Strategy to Create a Gene Expression Atlas of Zebrafish Embryogenesis
  
• A Computational Framework for Multilevel Morphologies
  
• A Framework for Modelling and Simulating Networks of Cells
  
• Parameter tuning of a stochastic biological simulator by metaheuristics
  

Theses

• Modellazione e simulazione ad agenti della morfogenesi di Drosophila Melanogaster
  

• Sviluppo di Metodi e Strumenti per l'Inferenza di Reti di Regolazione Genetica