NETSCALE – Ricostruzione e modellazione delle dinamiche molecolari e genetiche alla base della precoce regionalizzazione degli embrioni di zebrafish e di seaurchin

Info

• (funding body): Università Italo-Francese – Project Galileo 2008/2009
• (project acronym): NETSCALE
• (project full title): Ricostruzione e modellazione delle dinamiche molecolari e genetiche alla base della precoce regionalizzazione degli embrioni di zebrafish e di seaurchin
• (years): 2009-2010

The Galileo Program

Il Programma Galileo nasce con l'obiettivo di favorire la cooperazione scientifica tra Italia e Francia, istituito dal Ministero dell'Istruzione, dell'Università e della Ricerca, per l'Italia, dal Ministère des Affaires Etrangères et Européennes e dal Ministère de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche, per la Francia.
A tal fine il Programma finanzia le spese di mobilità per scambi di ricerca tra i due partner del progetto così da favorire la nascita di progetti in cooperazione su temi comuni.

Partners

• Alma Mater Studiorum—Università di Bologna, Cesena, Italy
  • Andrea Omicini (project coordinator)
  • Sara Montagna (principal investigator)
  • Mirko Viroli
  • Matteo Campana
  • Alessandro Sarti
• DEPNS (CNRS), Gif-sur-Yvette, France
  • Nadine Peyriéras (unit coordinator)
  • Sophie Desnoulez
  • Louise Duloquin

Publications

• A Computational Framework for Multilevel Morphologies (book chapter, 2012) — Sara Montagna, Mirko Viroli
• An Agent-based Model for the Pattern Formation in Drosophila Melanogaster (paper in proceedings, 2010) — Sara Montagna, Nicola Donati, Andrea Omicini
• A Framework for Modelling and Simulating Networks of Cells (paper in proceedings, 2010) — Sara Montagna, Mirko Viroli
• An Automatic Quantification and Registration Strategy to Create a Gene Expression Atlas of Zebrafish Embryogenesis (paper in proceedings, 2009) — Carlos Castro Gonzalez, Miguel Angel Luengo-Oroz, Sophie Desnoulez, Louise Duloquin, Laura Fernández-de-Manuel, Sara Montagna, Maria J. Ledesma-Carbayo, Paul Bourgine, Nadine Peyrieras, Andres Santos
• Parameter tuning of a stochastic biological simulator by metaheuristics (paper in proceedings, 2009) — Sara Montagna, Andrea Roli

Talks

• A Framework for Modelling and Simulating Networks of Cells  (talk, 10/06/2010) — Sara Montagna (Sara Montagna)

Theses

Environment

• Modellazione e simulazione ad agenti della morfogenesi di Drosophila Melanogaster (completed, 24/03/2010) — Nicola Donati
• Sviluppo di Metodi e Strumenti per l'Inferenza di Reti di Regolazione Genetica (1st cycle, 25/03/2009) — Adele Gori